Colombia e Indonesia cuentan con los siguientes instrumentos que apoyan la agenda bilateral:
- Convenio cultural y educativo.
- Acuerdo de Cooperación Económica y Técnica.
- Memorando de Entendimiento para el establecimiento de la comisión conjunta.
- Acuerdo de exención de visado para pasaportes diplomáticos, oficiales y de servicio.
- MoU en cooperación agrícola.
- MoU entre Confecámaras y la Cámara de Industria y Comercio (KADIN).
- Memorando de Entendimiento relativo a la cooperación en la lucha contra la producción ilícita, elaboración y tráfico de sustancias psicotrópicas, narcóticas y sus precursores.
- Memorando de Entendimiento contra el lavado de activos y la financiación del terrorismo.
- Memorando de Entendimiento en Cooperación en Salud.
- Memorando BANCOLDEX Colombia – Banco EXIM Indonesia.
- Memorando de Entendimiento sobre Consultas Políticas. 5 de agosto de 2020.
- Acuerdo de exención de Visas para portadores de pasaportes ordinarios. 5 de agosto de 2020.
- Memorando de Entendimiento entre la Autoridad Indonesia de alimentos y medicamentos (BPOM) y el Instituto Nacional de Vigilancia de Medicamentos y Alimentos de Colombia (INVIMA). Mayo 2022.
